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数据赋能丨APC(高级过程控制)在毕赤酵母蛋白表达工艺上的应用
来源:https://mp.weixin.qq.com/s/LveAKIY_1H2ONx-0O9BvBA?token=1277061370&lang=zh_CN | 作者:T&J | 发布时间: 2024-08-22 | 1377 次浏览 | 分享到:
巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)表达系统之所以可以严格控制外源基因的高效表达,是因为其拥有需要甲醇诱导的醇氧化酶 I 基因(AOX1)的诱导型启动子,几乎可以满足众多外源蛋白的简单发酵操作[1,3]。重组毕赤酵母的表达培养分为两个阶段,首先让重组毕赤酵母先在甘油的培养基中生长达到一定的细胞密度,再加入甲醇,启动蛋白的表达[2,4]。

引言


巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)表达系统之所以可以严格控制外源基因的高效表达,是因为其拥有需要甲醇诱导的醇氧化酶 I 基因(AOX1)的诱导型启动子,几乎可以满足众多外源蛋白的简单发酵操作[1,3]。重组毕赤酵母的表达培养分为两个阶段,首先让重组毕赤酵母先在甘油的培养基中生长达到一定的细胞密度,再加入甲醇,启动蛋白的表达[2,4]


在实际发酵过程中,往往需要人员的长时间的值守来进行补料切换,才能在合适的时间进行产物的诱导表达。为避免这一现象,现采用迪必尔生物工程的Interlli-Ferm mini 5L生物反应器,基于D2MS(设备和数据管理系统, Device & Data management system)的APC(高级功能过程控制,Advanced process control)实现毕赤酵母表达蛋白的自动化控制。


图 1毕赤酵母在油镜下的菌体形态


经试验结果显示, APC功能可以设置不同的触发条件,不同的补料策略来源,对多个补料泵进行准确时间点的自动化补料控制。并且在APC自动补料控制的条件下, 筛选出最优BSM培养基,该培养基经过甲醇诱导后,在142h时,毕赤酵母表达蛋白量可达到7,955.406mg/L。


材料与方法


实验场所:

迪必尔生物 应用技术与工程研究中心(CARE)


菌株类型:

毕赤酵母工程菌


反应器控制器:

Intelli-Ferm mini


控制系统:

D2MS(设备和数据管理系统, Device & Data management system)


罐体:

5L玻璃罐


培养基:

BSM培养基和1号培养基(表1)


表1 培养基配方



工艺参数条件:

见表2


表2 工艺控制参数


总蛋白含量测定方法:

利用Bradford 法对发酵上清液进行总蛋白含量测定。做出总蛋白质浓度C为0~200 mg/L 的标准曲线(图2)。得到吸光值与浓度之间的线性关系为:Y=295.74*X,R2=0.9962。

图 2总蛋白含量标准曲线


由以上公式可知,样品总蛋白浓度C=295.74*吸光值A595nm*稀释倍数N。


补料策略:

相较于传统的发酵罐补料,我们使用D2MS软件的APC功能,可以避免人员长时间的值守,实现自动化控制。我们可以设置不同的触发条件,不同的补料策略来源,对多个补料泵进行准确时间点的自动化补料控制。


补料思路是:

当第一次DO回升时,进行Feed1补料,且按照时间序列(图3b)进行;

当第二次DO回升时,进行Feed2补料,且按照时间序列(图3c)进行。


图 3 分阶段补料策略


结果与分析


整个培养过程


(1)APC自动化


如图4,在开启APC程序后,1号培养基罐和BSM培养基罐可以自动触发Feed1和Feed2的时序补料。由此可见,APC功能可以实现分段补料策略。


图 4  APC程序运行中


(2)DO变化趋势


由图4可知,两种培养基在前期(0-20h)生长速率不一致,1号培养基对应罐体菌体生长缓慢。



图 5各罐不同时间DO变化


由图5可知,在不同的培养阶段,毕赤酵母的发酵液呈现不同的状态.


图 6  不同时间段发酵液的变化


整个培养过程中发酵液各指标变化


(1)OD值和湿重


由图7和图8所知, 1号培养基对应的OD值最高为404(114.8h),湿重最高为325.3g/L(90.9h);BSM培养基对应的OD值最高为793(142h),湿重最高为485.7g/L(142h)。


图 7  各罐不同时间发酵液OD值



图 8  各罐不同时间菌体湿重


(2)胞外表达总蛋白含量


由表3可知,1号培养基在培养90.9h时,发酵液总蛋白含量达到最高721.606mg/L,BSM培养基在培养142h时,发酵液总蛋白含量达到最高7,955.406mg/L。


表3 各罐不同培养时间发酵上清液中总蛋白含量变化


总结


1、D2MS软件内的APC功能可以设置不同的触发条件,不同的补料策略来源,对多个补料泵进行准确时间点的自动化补料控制。


2、在APC自动补料控制的条件下,运用该工艺参数时,BSM培养基经过甲醇诱导后,毕赤酵母表达蛋白量优于1号培养基,且在142h时,总蛋白含量可达到7,955.406mg/L。



参考文献

[1]王锦佳.新型重组毕赤酵母中外源蛋白的诱导表达新工艺[D].华东理工大学,2017.

[2]鹿承建.重组毕赤酵母全细胞转化L-乳酸合成丙酮酸钠的工艺研究[D].福建师范大学,2020.DOI:10.27019/d.cnki.gfjsu.2020.001013.

[3]张丽华.重组毕赤酵母中10-HDA的生物合成研究[D].齐鲁工业大学,2021.DOI:10.27278/d.cnki.gsdqc.2021.000451.

[4]赵允章.毕赤酵母(Pichia pastoris)LNF013产纳豆激酶发酵优化及发酵动力学研究[D].辽宁大学,2023.DOI:10.27209/d.cnki.glniu.2023.000840.


应用技术与工程研究中心(CARE) 管志欣 供稿