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国内率先将微小型平行生物反应器成功研发并商业化的制造商
酿酒酵母在平行生物反应器的培养条件优化
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酿酒酵母细胞是第一个被全基因组测序的真核生物,常应用于有机酸、核苷酸、醇类、蛋白质等的生产,具有生长速度较快、遗传背景清晰、遗传操作简单、大规模发酵技术成熟等优点,已成为合成生物学和代谢工程技术中重要的底盘细胞之一。

前言


酿酒酵母细胞是第一个被全基因组测序的真核生物,常应用于有机酸、核苷酸、醇类、蛋白质等的生产,具有生长速度较快、遗传背景清晰、遗传操作简单、大规模发酵技术成熟等优点,已成为合成生物学和代谢工程技术中重要的底盘细胞之一。


培养基配方、工艺参数控制对菌株的生长和产物表达有很重要的影响,而性能优异的平行生物反应器有助于减少时间成本、提高工艺开发效率。本案例采用迪必尔CloudReady™(1.5L)平行生物反应器培养表达Red mRuby2的酿酒酵母细胞,为其高密度培养提供解决方案和数据支持。



条件筛选


第一批实验尝试筛选适宜菌株生长的pH和补料策略,在9h底物耗尽时开始补料,至48h结束培养,控制条件如表1。


图1-3是第一批次四台罐体R1~R4的DO曲线、OD600和湿重数据。从图表可知,pH控制4.0,补料关联时间序列进行控制,并设置搅拌和通气关联DO的双向调节更有利于该菌株的生长。


表1 第一批实验控制条件


图1 第一批次DO曲线


图2 第一批次OD600


图3 第一批次湿重


条件验证


基于第一批实验筛选出的最优条件,第二批实验更换培养基配比进行四罐体的平行测试。平行生物反应器培养表达Red mRuby2的酿酒酵母的运行状态见图4,样液在绿光下激发出红光(图5)。


图4 平行生物反应器运行状态


图5 Red mRuby2在绿光下激发出红光


该批次在17h底物耗尽时开始补料,73h结束培养,最终OD600达到180,湿重达到280g/L。图6-8是第二批次四台罐体R1~R4的DO曲线、OD600和湿重数据。


图6 第二批次DO曲线


图7 第二批次OD600


图8 第二批次湿重


分析与展望


本案例基于CloudReadyTM(1.5L)平行生物反应器,首先通过对发酵过程pH、补料策略、搅拌转速控制等条件的测试筛选出最适合菌株生长的体系,然后通过优化培养基配比使酿酒酵母最终OD600达到180,湿重达到280g/L,两个指标较优化前均提升3倍以上。


未来在其他方面还有较大的优化空间,如以蛋白浓度为响应进行DoE实验,通过对温度、pH、DO、补料速度、通气流量等参数的工艺优化提高蛋白产量,探究更合适的酵母发酵生产工艺。


迪必尔生物 应用技术与工程研究中心(CARE)柴金言 供稿